Q值定义
指定碱基的测序质量分值Q是按照如下公式定义的：
Q = -10log10(e)
其中e是预估的碱基错误检出率。Q值高，说明错误率低。Q值低，可能会导致不可用read的比例显著增高。还可能导致假阳性变异检出率增加，得出不正确的结论。
测序质量分值与碱基检出精确度的关系
| 质量分值 | 碱基的错误检出率 | 推断的碱基检出精确度 |
|---|---|---|
| 10 (Q10) | 1/10 | 90% |
| 20 (Q20) | 1/100 | 99% |
| 30 (Q30) | 1/1000 | 99.9% |
参考文件
Ewing B, Green P. (1998): Base-calling of automated sequencer traces using phred. II. Error probabilities. Genome Res. 8(3):186-194